นายกรัฐมนตรี เชื่อว่าการส่งตัวชาวอุยกูร์ 109 คนให้ทางการจีนก่อนหน้านี้ ไม่ใช่มูลเหตุของคดีระเบิด แยกราชประสงค์ ขัดแย้งกับการให้ข้อมูลของผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ ที่ออกมายอมรับเป็นครั้งแรกว่า กรณีดังกล่าวมีความเชื่อมโยงกัน 

พลเอก ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรีและหัวหน้า คสช. กล่าวถึงคดีระเบิดที่แยกราชประสงค์  ส่วนตัวเชื่อว่าอาจจะยังไม่เกี่ยวข้องกับกรณีทางการไทยส่งตัวอุยกูร์กลับประเทศจีน แต่แนวทางการสืบสวนขณะนี้ยังไม่ตัดประเด็นใดทิ้งไป ทั้งอาชญากรรม ขบวนการค้ามนุษย์ และชาวอุยกูร์แต่ยืนยันว่าการดำเนินการกับผู้ที่หลบหนีเข้าเมืองก็เป็นไปตามกระบวนการขั้นตอน ถูกต้องที่สุดแล้ว  

พลตำรวจเอกสมยศ พุ่มพันธุ์ม่วง ผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ กล่าวถึงความคืบหน้าคดีระเบิดที่แยกราชประสงค์ ขณะนี้มีความเป็นไปได้มากว่า มูลเหตุจูงใจของการก่อเหตุนั้น  เป็นเครือข่ายธุรกิจการค้ามนุษย์ ซึ่งลักลอบขนคนจากมณฑลซินเจียง-อุยกูร์ ไปยังประเทศตุรกี 

เมื่อทางการไทยทำลายเครือข่ายธุรกิจดังกล่าว จึงกระทำการล้างแค้น ทั้งนี้ ยืนยันว่าการส่งตัวชาวอุยกูร์กลับประเทศจีน เป็นไปตามกฎหมายระหว่างประเทศโดยถูกต้องแล้ว 

พร้อมกันนี้ ยังยืนยันว่า ทางการไทย มีนโยบายที่จะไม่เป็นทางผ่านให้แก่ผู้เข้าเมืองผิดกฎหมาย ไม่ว่าจะอยู่ในกลุ่มใด การส่งตัวชาวอุยกูร์กลับจีน ก็สอดคล้องกับนโยบายดังกล่าว จึงไม่ควรที่จะมีใครมาโกรธแค้นรัฐบาลไทยเพราะเหตุดังกล่าว